Su proposta della Corte plenaria, l'Assemblea federale elegge la presidenza del Tribunale. L'elezione si tiene ogni due anni. La rielezione nella rispettiva funzione è possibile, ma una sola volta. Il presidente rappresenta il Tribunale verso l’esterno, dirige la Corte plenaria e la Commissione amministrativa.
Per l'anno 2025 l'Assemblea federale ha nominato alla presidenza Claudia Cotting-Schalch. Vicepresidente sarà Contessina Theis.
